موزه تاریخ طبیعی همدان، مجموعه ای کمنظیر از نمونه انواع گونههای حیوانی، گیاهی و طبیعی اقلیم ایران و اقصی نقاط کره خاکی است که تماشای آن ذهن هربینندهای را به گذشته و حال اعماق آبها و فراز خاکها میکشاند. مساحت تقریبی این موزه 2000 متر مربع است.
در لابه لای این مجموعه اعجاب انگیز که هم اینک به عنوان یکی از گران بهاترین سرمایه های ملی و بستری برای مطالعات دانش پژوهان و اهل تحقیق شناخته شده است، هزاران نمونهٔ زنده، سنگواره و تاکسی درمی شده از گونه های گیاهی پستانداران، پرندگان، خزندگان، حشرات و آبزیان به شیوه های مدرن و علمی نگهداری می شود.
همچنین از شناسنامه موزه که در دسترس قرار دارد، چنین برمی آید که بیش از 500 نمونه پرنده و 140 نمونه از پستانداران متعلق به دوره های کهن تا عصر حاضر مختص اقلیم ایران که نسل بسیاری از آنان تاکنون منقرض شده یا در حال انقراض است را می توان در موزه تماشا و مطالعه کرد.
بنیان موزه تاریخ طبیعی در همدان سال 1351به همت انسانی علاقه مند و سخت کوش و چند تن از دبیران دبیرستان و اساتید دانشگاه در سالن کوچک و محدود در گوشه ای از دبیرستان موسوم به پهلوی آن زمان گذاشته شده است.
این موزه هم اینک در چند تالار مجهز و آراسته به وسعت 2000 مترمربع به چند فضای مناسب برای مطالعه، سالن سخنرانی و کتابخانه تخصصی در دانشکده کشاورزی دانشگاه بوعلی سینا تجهیز شده است. از موزه تاریخ طبیعی همدان روزانه حدود 300نفر از دوست داران مظاهر طبیعت وحشی، اهل تحقیق و پژوهشگران از سراسر ایران دیدن می کنند.
این موزه به همت استاد جعفر محمد علیزاده احداث شده و تمام نمونه ها با همت ایشان و دانشجویان علاقه مند جمع آوری شده است.